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创世界纪录!深企新技术1分钟解码基因|足球外围APP
时间:2020-12-13 来源:足球外围APP 浏览量 3257 次

官网首页_表明基因测序技术发展缓慢,基因数据的分解呈指数级快速增长,也明确对检测速度和分析能力提出了更高的排斥。近日,深圳承启生物云计算平台搭载自主研发的FANSe三代算法,创下世界纪录。

第一次构建为一分钟分析一个人近2万条基因信息,比之前的同类技术慢了几十倍,准确率提高的难以置信。这项技术突破将随着基因检测的速度和成本取得质的进步,面向所有人的精确医学时代将会加速。

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FANSe的第三代算法杀死了其他算法。每个人的基因组由60亿个碱基组成,编码2万多个基因。

人的生老病死都在这些基因序列中,彼此不同。所以精密医学的基础是大规模基因组测序。随着大规模测序技术的缓慢变化,只需要几个小时就可以测量出所有两万多个基因的序列,但在过去,需要在几天内计算出如此庞大的基因数据。

为了防止“测序五分钟,计算两小时”的失望,人们以前的解决方案无非是用超级计算机或者开发特殊的加速芯片来加速。但这带来了成本高、灵活性差、准确性低的问题,受到了医学界的批评。

为了克服这个难题,深圳市承启生物科技有限公司(以下简称承启生物科技)花了三年时间,几乎自律性地研发了高精度的FANSe第三代算法和测序数据分析云平台,在58秒内分析了一个人近2万个基因的数亿个碱基信息,创造了世界纪录。“我们和天河二号超级计算机合作。只要有必要,计算中国13亿人的遗传信息就需要十天。

”FANSe算法的开发者张工教授说,它需要任何特性来加速芯片,这使得这个方案更容易开发。成奇生物开发的系统不仅速度慢得令人难以置信,而且精度也大大提高。在算法设计之初,张工教授就设定了一个严格的目标,“分析误差在任何情况下都不应该高达一亿,打破所有传统算法。”我终于知道我做到了。

大量实验测试表明,FANSe系列算法在DNA变异分析和RNA传输分析中的准确率为100%,仅次于国外基于BWA、鲍蒂等算法的方案,在医学研究和临床实践中积累了许多成功案例。已在5天内为晚期胰腺癌患者寻找合适的靶向药物,累计分析研究/临床病例2万余例。2017年11月,承启生物已经在英国《核酸研究》杂志上发表了一篇核酸研究领域的国际顶级期刊论文。利用该系统,成功构建了人类纯mRNA组的二级分析,即人类纯mRNA组的测序数据在一秒多时间内得到分析,并向全世界科研人员免费开放,创造了测序分析的新世界纪录。

云平台已经完成了50多万个样本的基因分析。从1999年科学家开始解码人类基因组开始,医生们就已经预言了“精密医学”的时代。随着基因测序技术和医学科学的发展,医学化疗正逐步走向个性化精确医学时代。

陈女士临床诊断为乳腺癌,害怕化疗药物选择不当带来的副作用,于是去承气生物对2万多个基因进行了全序列分析。测序完成当天,云平台迅速分析了其基因数据,发现医生原用药方案中的多西他赛疗效差,副作用大。家属与医生冷静沟通后,医生根据陈女士的基因检测结果调整用药方案,用于引进阿霉素、环磷酰胺的人群,这是一种精确计算的化疗药物形式。

经过两个周期的化疗,效果非常明显,肿瘤增大。陈女士没有感觉到明显的呼吸困难,但她的食欲增加了ra 它以人类基因组信息为基础,整合蛋白质组、代谢组学等与内环境相关的信息,为患者量身定制最佳化疗方案,包括用药方案等。以期超过化疗效果的最大化和副作用的最小化。记者了解到,成奇生物的这个高速分析云平台,在医学科研和临床应用中,已经分析了多达50万个样本,寻找罕见病毒感染疾病的病因,为晚期癌症患者寻找合适的药物,结果都令人满意,挽救了很多生命。

正是因为这些成就,FANSe算法的开发者张工教授成为为数不多的受邀在基因测序领域做ted演讲的中国科学家。“一分钟可以分析近两万条遗传信息,这意味着大规模测序的分析仍将是未来的瓶颈。”张工教授说,有了这些新技术的帮助,在不久的将来,人们做基因检测会更加方便、快捷、廉价、有益,全民精确医学时代指日可待。

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